Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PltpP55065 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PltpP55065 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PltpP55065 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PltpP55065 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PltpP55065 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PltpP55065 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PltpP55065 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PltpP55065 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PltpP55065 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PltpP55065 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PltpP55065 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PltpP55065 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PltpP55065 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PltpP55065 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PltpP55065 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PltpP55065 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PltpP55065 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms