Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2e1P52482 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2e1P52482 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms