Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cav1P49817 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cav1P49817 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms