Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atoh1P48985 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atoh1P48985 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms