Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcd1P48410 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd1P48410 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcd1P48410 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcd1P48410 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcd1P48410 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcd1P48410 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcd1P48410 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcd1P48410 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcd1P48410 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Abcd1P48410 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms