Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gad1P48318 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gad1P48318 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gad1P48318 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gad1P48318 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gad1P48318 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms