Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syt1P46096 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syt1P46096 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syt1P46096 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syt1P46096 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syt1P46096 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms