Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx2-5P42582 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx2-5P42582 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx2-5P42582 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx2-5P42582 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx2-5P42582 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkx2-5P42582 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkx2-5P42582 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms