Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sox7P40646 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox7P40646 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms