Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VhlP40338 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VhlP40338 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VhlP40338 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VhlP40338 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VhlP40338 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VhlP40338 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VhlP40338 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VhlP40338 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VhlP40338 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VhlP40338 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms