Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.01	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RAD4	YER162C	2265 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	NUP85	YJR042W	2235 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YRB30	YGL164C	1323 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	PRM2	YIL037C	1971 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RPN2	YIL075C	2838 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	FUN12	YAL035W	3009 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RSC1	YGR056W	2787 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	DET1	YDR051C	1005 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	CNN1	YFR046C	1086 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	MRPL24	YMR193W	777 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YNL320W	YNL320W	855 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SPO77	YLR341W	1434 nt		3	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YHR080C	YHR080C	4038 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SEC6	YIL068C	2418 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	ARO1	YDR127W	4767 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	AIP1	YMR092C	1848 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	PFA5	YDR459C	1125 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RPS0A	YGR214W	759 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YHI9	YHR029C	885 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	POG1	YIL122W	1056 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SNO1	YMR095C	675 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	PRX1	YBL064C	786 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YOL079W	YOL079W	399 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	ALG11	YNL048W	1647 nt		2.99	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	REC8	YPR007C	2043 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	PFK26	YIL107C	2484 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	ETP1	YHL010C	1758 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	AAD3	YCR107W	1092 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YDL071C	YDL071C	375 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	COS7	YDL248W	1152 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	DAN1	YJR150C	897 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	COS5	YJR161C	1152 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	TRI1	YMR233W	681 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	ATG8	YBL078C	354 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RPC34	YNR003C	954 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	DSC2	YOL073C	969 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	MDM38	YOL027C	1722 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	NRP1	YDL167C	2160 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	VTC4	YJL012C	2166 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SMI1	YGR229C	1518 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	MIH1	YMR036C	1665 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	IME4	YGL192W	1803 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SNQ2	YDR011W	4506 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	TGL3	YMR313C	1929 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	ARP4	YJL081C	1470 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SPO1	YNL012W	1896 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	MGT1	YDL200C	567 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	TOM20	YGR082W	552 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RHO5	YNL180C	996 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RPS7A	YOR096W	573 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	GAS2	YLR343W	1668 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	RKM3	YBR030W	1659 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	MNR2	YKL064W	2910 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	SUP45	YBR143C	1314 nt		2.96	□□□□□ -1.93
SHE2	P36068	CIN8	YEL061C	3003 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	VPS53	YJL029C	2469 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	TRM13	YOL125W	1431 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CWC2	YDL209C	1020 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YDR391C	YDR391C	699 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	RPL30	YGL030W	318 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CWC25	YNL245C	540 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YNR071C	YNR071C	1029 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YPR015C	YPR015C	744 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	TYR1	YBR166C	1359 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	NAT1	YDL040C	2565 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CTR86	YCR054C	1692 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	MUM3	YOR298W	1440 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YDL176W	YDL176W	2127 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	SPO14	YKR031C	5052 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	COP1	YDL145C	3606 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YEL028W	YEL028W	462 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	TYS1	YGR185C	1185 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	PET54	YGR222W	882 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	DLS1	YJL065C	504 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	SPC34	YKR037C	888 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YLR462W	YLR462W	609 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CMR3	YPR013C	954 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	SSE2	YBR169C	2082 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	NAM9	YNL137C	1461 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	SMP3	YOR149C	1551 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CSR2	YPR030W	3366 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YIR040C	YIR040C	333 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	ECM4	YKR076W	1113 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YNL013C	YNL013C	378 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	VAM10	YOR068C	345 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	GPB1	YOR371C	2694 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	SET1	YHR119W	3243 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	MRH4	YGL064C	1686 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	CPR1	YDR155C	489 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YPT35	YHR105W	645 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	HTA2	YBL003C	399 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	GOT1	YMR292W	417 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SHE2	P36068	TCM62	YBR044C	1719 nt		2.93	□□□□□ -1.94

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