Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2aP35436 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2aP35436 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2aP35436 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms