Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab20P35295 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab20P35295 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms