Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab6aP35279 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab6aP35279 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms