Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stfa3P35173 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stfa3P35173 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms