Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apoc3P33622 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apoc3P33622 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms