Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf8P32972 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf8P32972 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms