Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb3P28231 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gjb3P28231 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms