Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CenpbP27790 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CenpbP27790 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CenpbP27790 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CenpbP27790 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CenpbP27790 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms