Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2afxP27661 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2afxP27661 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms