Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb7P26011 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb7P26011 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb7P26011 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms