Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ntf3P20181 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms