Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VimP20152 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VimP20152 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VimP20152 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VimP20152 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VimP20152 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VimP20152 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VimP20152 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VimP20152 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms