Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb2P0C1T1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb2P0C1T1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms