Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pax1P09084 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax1P09084 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms