Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc8P09025 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc8P09025 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms