Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna5P07349 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna5P07349 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms