Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SparcP07214 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SparcP07214 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SparcP07214 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SparcP07214 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SparcP07214 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SparcP07214 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SparcP07214 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SparcP07214 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SparcP07214 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SparcP07214 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SparcP07214 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms