Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxa7P02830 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxa7P02830 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms