Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifnb1P01575 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifnb1P01575 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifnb1P01575 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms