Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nid2O88322 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nid2O88322 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nid2O88322 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms