Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt5hO55201 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt5hO55201 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt5hO55201 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt5hO55201 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt5hO55201 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt5hO55201 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt5hO55201 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt5hO55201 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt5hO55201 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt5hO55201 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt5hO55201 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Supt5hO55201 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.7 ms