Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NlkO54949 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NlkO54949 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NlkO54949 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NlkO54949 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NlkO54949 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NlkO54949 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NlkO54949 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NlkO54949 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms