Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stag2O35638 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stag2O35638 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms