Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stx1aO35526 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx1aO35526 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms