Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppef2O35385 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppef2O35385 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms