Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casq1O09165 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casq1O09165 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms