Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20795J3QP49 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm20795J3QP49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20795J3QP49 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Gm20795J3QP49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20795J3QP49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20795J3QP49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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