Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colca2F8VPY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Colca2F8VPY8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Colca2F8VPY8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms