Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcdc2bF7BCK0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Dcdc2bF7BCK0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dcdc2bF7BCK0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms