Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rarres1F6ZIS7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rarres1F6ZIS7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms