Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sptbn5F6UCX4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn5F6UCX4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sptbn5F6UCX4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms