Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf212F6TQD1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf212F6TQD1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf212F6TQD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf212F6TQD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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