Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
8030474K03RikE9Q4Y8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
8030474K03RikE9Q4Y8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms