Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fndc1E9Q043 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fndc1E9Q043 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fndc1E9Q043 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fndc1E9Q043 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms