Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ryr1E9PZQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms