Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd2E9PZM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chd2E9PZM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chd2E9PZM4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd2E9PZM4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chd2E9PZM4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chd2E9PZM4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chd2E9PZM4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms