Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb3D3Z6J4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms