Protein–RNA interactions for Protein: D3YVV3

Ankrd29, Ankyrin repeat domain 29, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd29D3YVV3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ankrd29D3YVV3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ankrd29D3YVV3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms