Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap58B2RW38 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfap58B2RW38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms